Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms