Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms