Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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