Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LPIN3Q9BQK8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LPIN3Q9BQK8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LPIN3Q9BQK8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LPIN3Q9BQK8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LPIN3Q9BQK8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms