Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms