Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms