Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145 ms