Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms