Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF34Q969K3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms