Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms