Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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