Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM41Q8WV44 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms