Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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GDPD1Q8N9F7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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GDPD1Q8N9F7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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GDPD1Q8N9F7 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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GDPD1Q8N9F7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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GDPD1Q8N9F7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GDPD1Q8N9F7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GDPD1Q8N9F7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GDPD1Q8N9F7 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GDPD1Q8N9F7 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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