Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms