Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms