Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDXQ7Z353 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms