Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC19Q6DKK2 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms