Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD1Q5SYB0 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms