Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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COL5A1-AS1Q5SY13 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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COL5A1-AS1Q5SY13 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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COL5A1-AS1Q5SY13 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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COL5A1-AS1Q5SY13 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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COL5A1-AS1Q5SY13 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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