Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms