Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSD17B12Q53GQ0 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms