Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms