Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHKAPQ2M3C7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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