Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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