Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms