Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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