Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms