Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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TAF1AQ15573 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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