Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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