Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3GAP1Q15042 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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RAB3GAP1Q15042 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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