Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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RFTN1Q14699 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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RFTN1Q14699 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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RFTN1Q14699 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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