Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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