Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms