Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PTCH1Q13635 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PTCH1Q13635 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PTCH1Q13635 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PTCH1Q13635 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PTCH1Q13635 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
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PTCH1Q13635 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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