Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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TCIRG1Q13488 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCIRG1Q13488 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms