Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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