Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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