Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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