Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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