Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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