Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME3Q13232 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NME3Q13232 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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