Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CBX3Q13185 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CBX3Q13185 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CBX3Q13185 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CBX3Q13185 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBX3Q13185 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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