Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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GPS1Q13098 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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GPS1Q13098 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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