Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms