Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms