Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms