Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms