Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms