Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRB1P82279 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRB1P82279 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRB1P82279 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRB1P82279 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB1P82279 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB1P82279 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB1P82279 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRB1P82279 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms