Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JAG1P78504 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JAG1P78504 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JAG1P78504 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms